Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms