Protein–RNA interactions for Protein: B9UIU9

Gm17660, Predicted gene, 17660, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17660B9UIU9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17660B9UIU9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17660B9UIU9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms