Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmf1B9EKI3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmf1B9EKI3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmf1B9EKI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms