Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Syce3B5KM66 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce3B5KM66 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms