Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zscan5bB2RTN3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zscan5bB2RTN3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms