Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mbd5B1AYB6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mbd5B1AYB6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mbd5B1AYB6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms