Protein–RNA interactions for Protein: B1AX85

6030498E09Rik, RIKEN cDNA 6030498E09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030498E09RikB1AX85 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
6030498E09RikB1AX85 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
6030498E09RikB1AX85 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms