Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nipsnap3aB1AWZ3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nipsnap3aB1AWZ3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms