Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scml2B1AVB3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scml2B1AVB3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scml2B1AVB3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms