Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Skint2A7XUX6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skint2A7XUX6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms