Protein–RNA interactions for Protein: A7UAK5

Pfkfb3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-biphosphatase 3 splice variant 2, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfkfb3A7UAK5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pfkfb3A7UAK5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pfkfb3A7UAK5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pfkfb3A7UAK5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms