Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prr16A3KMN5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prr16A3KMN5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prr16A3KMN5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms