Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttll9A2APC3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll9A2APC3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms