Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rbbp8nlA2ABX0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms