Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pramef6A2A8M8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramef6A2A8M8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef6A2A8M8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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