Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pabpc1lA2A5N3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc1lA2A5N3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc1lA2A5N3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms