Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm8521-201ENSMUST00000190394 606 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Nuf2-203ENSMUST00000192248 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Smpd1Q04519 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms