Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrit3W8DXL4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrit3W8DXL4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms