Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3550W4VSN7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm3550W4VSN7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3550W4VSN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms