Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28036V9GXJ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28036V9GXJ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm28036V9GXJ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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