Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cog1Q9Z160 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog1Q9Z160 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms