Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cpne6Q9Z140 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cpne6Q9Z140 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cpne6Q9Z140 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms