Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AireQ9Z0E3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AireQ9Z0E3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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