Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cul1Q9WTX6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul1Q9WTX6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms