Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skp1Q9WTX5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms