Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDX41Q9UJV9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX41Q9UJV9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX41Q9UJV9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DDX41Q9UJV9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX41Q9UJV9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX41Q9UJV9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX41Q9UJV9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX41Q9UJV9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX41Q9UJV9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDX41Q9UJV9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms