Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PplQ9R269 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PplQ9R269 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PplQ9R269 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PplQ9R269 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PplQ9R269 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PplQ9R269 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PplQ9R269 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PplQ9R269 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PplQ9R269 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PplQ9R269 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PplQ9R269 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PplQ9R269 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PplQ9R269 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms