Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trpc2Q9R244 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc2Q9R244 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc2Q9R244 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms