Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc26a4Q9R155 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc26a4Q9R155 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a4Q9R155 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms