Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vav3Q9R0C8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vav3Q9R0C8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vav3Q9R0C8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms