Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fhl3Q9R059 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fhl3Q9R059 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms