Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atp11cQ9QZW0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp11cQ9QZW0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms