Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ubxn8Q9QZ49 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ubxn8Q9QZ49 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ubxn8Q9QZ49 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms