Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Map1aQ9QYR6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Map1aQ9QYR6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms