Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cln8Q9QUK3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cln8Q9QUK3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cln8Q9QUK3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms