Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cdc42ep4Q9JM96 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdc42ep4Q9JM96 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms