Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrfQ9JM73 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrfQ9JM73 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms