Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Scamp4Q9JKV5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scamp4Q9JKV5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scamp4Q9JKV5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms