Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnga3Q9JJZ8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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