Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Alyref2Q9JJW6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alyref2Q9JJW6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms