Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad9Q9JIW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad9Q9JIW5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms