Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rb1cc1Q9ESK9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rb1cc1Q9ESK9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Rb1cc1Q9ESK9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rb1cc1Q9ESK9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms