Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ush1cQ9ES64 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms