Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tfip11Q9ERA6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tfip11Q9ERA6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms