Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Capn12Q9ER56 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Capn12Q9ER56 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Capn12Q9ER56 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms