Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pop7Q9DCH2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pop7Q9DCH2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms