Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Med27Q9DB40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med27Q9DB40 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms