Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn3Q9DAW9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn3Q9DAW9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn3Q9DAW9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnn3Q9DAW9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnn3Q9DAW9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnn3Q9DAW9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms