Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc54Q9DAL3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc54Q9DAL3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms