Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc89Q9DA73 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms